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AgriPheno訂閱號推送文章匯編(2024年4-6月)
日期:2024-08-14 14:15:00

AgriPheno訂閱號專注于持續(xù)更新植物生理生態(tài)、植物表型組學(xué)和基因組學(xué)、基因分型、智能化育種及應(yīng)用、激光雷達探測技術(shù)及數(shù)據(jù)分析等領(lǐng)域,國內(nèi)外最新資訊、戰(zhàn)略與政策導(dǎo)讀。本文節(jié)選了2024年4-6月推送的代表性文章,以供大家參閱。

高光譜

? 使用基于機器學(xué)習的光譜方法對獼猴桃進行無損質(zhì)量評估

本研究使用Specim IQ(Specim Ltd.,芬蘭奧盧)高光譜相機采集海沃德(Hayward)獼猴桃高光譜數(shù)據(jù),同時使用紋理分析儀TA XT2i、烘干法、數(shù)字折射計Atago PR-1和Folin–Ciocalteu法分別測定每個標記水果的果皮硬度(N)、DM含量(%)、SSC(%)和單寧含量。采用偏最小二乘回歸(PLSR)、袋裝樹(Bagged Trees, BTs)和三層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(TLNN)三種機器學(xué)習算法, 利用非破壞性高光譜成像方法評估海沃德獼猴桃內(nèi)部質(zhì)量(SSC、DM含量、硬度、單寧含量等生理特征)。

? 紫外線脅迫對甜葉菊抗氧化能力、光合活性、類黃酮和甜菊糖苷積累的影響

本研究提出的評估紫外線照射對甜葉菊植物葉片中SG濃度影響的方法,使我們能夠評估不同范圍紫外線照射的效果,從而改進甜葉菊種植技術(shù),在完全受控的環(huán)境農(nóng)業(yè)中獲得更高質(zhì)量的產(chǎn)量。未來的研究將重點關(guān)注不同劑量的紫外線照射對葉片SG濃度和植物生理機能的影響。

植物根系研究

? Scientia Horticulturae:不同砧木柑桔細根動態(tài)變化和空間分布

該研究采用了植物根系生長監(jiān)測系統(tǒng)CI-600 (美國CID)作為圖像采集單元,該設(shè)備可掃描獲取近360°的微根管圖像,單幅圖像圖幅可達21.59 cm×19.56 cm,可用于較長時間尺度的根系生長動態(tài)研究;配套WinRHIZO Tron軟件,不僅可以獲取根長、根表面積等根系功能性狀,還可基于Session模式提取不同土層深度的根系生長動態(tài)。

? X光根系分析系統(tǒng)RootViz FS:植物根系的“透視眼”

RootViz FS,不僅僅是一套設(shè)備,更是植物根系研究的“透視眼”。它通過X光掃描成像分析,對盆栽植物的根系進行非破壞性的原位成像分析。想象一下,只需短短幾分鐘,你就能獲得植物根系的立體X光照片,全方位觀察根系的每一個細節(jié)。

? 土壤結(jié)構(gòu)梯度和生長年限對4種旱生植物細根分布的影響

該研究借助細根垂直分布指數(shù)、細根生物量、細根根長密度、比根長、細根直徑、細根組織密度等,量化了土壤石礫含量對根系生物量和根系形態(tài)的影響。

植物表型/激光雷達

? 精準農(nóng)業(yè)新突破:無人機激光雷達(UAS LiDAR)三維作物表型分析

在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技的浪潮中,精準農(nóng)業(yè)(Precision Agriculture, PA)正成為提高作物產(chǎn)量和質(zhì)量的關(guān)鍵。近期,一項發(fā)表在Remote Sensing上的研究,為我們揭示了如何利用無人機搭載的激光雷達(UAS LiDAR)技術(shù),對作物的三維結(jié)構(gòu)進行精確表型分析,從而為農(nóng)業(yè)管理提供更為精準的數(shù)據(jù)支持。

? Nature:"智慧株型"基因提高玉米密植產(chǎn)量

2024年6月12日,Nature在線發(fā)表了中國農(nóng)業(yè)大學(xué)田豐課題組和李繼剛課題組的合作研究論文“Maize smart-canopy architecture enhances yield at high densities”。該研究首次在玉米中鑒定到“智慧株型”基因lac1,揭示了光信號動態(tài)調(diào)控lac1促使玉米適應(yīng)密植的分子機制,建立了“一步成系”的單倍體誘導(dǎo)編輯技術(shù)體系。

新觀點/新技術(shù)

Nature Communications:制備具有酶促二氧化碳固定能力的人造葉子

陜西科技大學(xué)研究團隊在紙上繪制葉子并賦予其天然葉子的基本功能,包括光捕獲、碳固定、氣孔調(diào)節(jié)和物質(zhì)運輸,構(gòu)建了一種仿生功能化的葉子——EcoLeaf。EcoLeaf具有與天然葉子相似的纖維素組成和機械強度,能夠在使用過程中無縫融入生態(tài)系統(tǒng),并在其生命周期結(jié)束時參與自然降解和養(yǎng)分循環(huán)過程。EcoLeaf的碳固定途徑是可適應(yīng)的,可以作為未來各種生物碳固定途徑的通用仿生平臺。

? 只測葉綠素當然是不夠的,還有……

德國WALZ最新發(fā)布的LSA-2050固件增加氮平衡指數(shù)(NBI)的測量,NBI被定義為葉綠素與吸收紫外線的酚類物質(zhì)(主要是類黃酮)的濃度比。制定 NBI的依據(jù)是,葉綠素含量隨氮素供應(yīng)量的增加而增加,而酚類物質(zhì)含量則呈平行下降趨勢。由于這些相反的關(guān)系,與葉綠素和酚類物質(zhì)的單個濃度相比,NBI對植物氮狀況的潛在反應(yīng)更為敏感和穩(wěn)健。

? Science Advances:研究團隊首次使用CRISPR/Cas9改變水稻光合作用

2024年6月7日,Science Advances在線發(fā)表美國加州大學(xué)伯克利分校植物與微生物生物學(xué)系Krishna K. Niyogi課題組題為"Multiplexed CRISPR-Cas9 mutagenesis of rice PSBS1noncoding sequences for transgene-free overexpression"的最新研究論文。報道了該研究小組通過CRISPR/Cas9工具編輯植物中自然存在的參與光保護過程的基因來改變光合作用。

? Implexx│插針式莖流傳感器的新突破

你是否對植物的水分運輸過程感到好奇?你是否想知道如何準確地測量植物的莖流?這篇文章中,我們將探討一種新的熱脈沖法,它可以解決傳統(tǒng)熱脈沖法在測量植物莖流時的局限性。

? 光合海蛞蝓的光保護機制揭示宿主和寄主的相容性

在神奇的自然界中,有些動物也能夠利用光合作用為自己提供能量。海蛞蝓,這種小型海洋生物,正是通過盜取藻類中的葉綠體來實現(xiàn)光合作用的。但是,當它們面臨強光脅迫時,這些“太陽能驅(qū)動”的生物又是如何保護自己的呢?今天,我們要介紹的是一項突破性的研究,利用Imaging-PAM技術(shù),為我們揭示了海蛞蝓在光合作用中的光保護機制。

? 新發(fā)現(xiàn):有機染料可提高藻類光譜吸收效率

科學(xué)家借助Dual-PAM-100開展的這項研究為微藻培養(yǎng)系統(tǒng)中光譜轉(zhuǎn)換的應(yīng)用開辟了新道路,對提高微藻生長和代謝物生物合成效率意義重大,不僅為微藻生物技術(shù)領(lǐng)域帶來了創(chuàng)新,也為實現(xiàn)綠色能源的可持續(xù)發(fā)展提供了新的可能性。

生物技術(shù)/育種技術(shù)

aBIOTECH:用于水稻核心啟動子編輯的CRISPR/FrCas9系統(tǒng)的開發(fā)

近期,安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院水稻研究所李娟與安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)魏鵬程團隊在aBIOTECH發(fā)表了題為“Developing a CRISPR/FrCas9 system for core promoter editing in rice”的研究論文。研究團隊設(shè)計了一種獨特的FrCas9系統(tǒng),并利用該系統(tǒng)在水稻中進行基因編輯,展示了其編輯植物核心啟動子區(qū)域的潛力。

? Nature Communications:辣椒T2T無缺基因組的組裝以及辣椒素生物合成通

本研究深入解析了辣椒著絲粒序列特征,發(fā)現(xiàn)獨特的重復(fù)序列元件;通過系統(tǒng)發(fā)育分析,估計了辣椒素類物質(zhì)合成通路的進化時間節(jié)點,并揭示了辣味形成和喪失的遺傳基礎(chǔ)。

? Nature揭示TWA1在擬南芥熱耐受性中的關(guān)鍵作用

文章發(fā)現(xiàn)并報道了一種感應(yīng)溫度的轉(zhuǎn)錄輔助調(diào)節(jié)因子TWA1。TWA1在高溫下可以發(fā)生構(gòu)象改變并在細胞中積累,調(diào)控熱休克轉(zhuǎn)錄因子A2(HSFA2)和熱休克蛋白的轉(zhuǎn)錄。TWA1是擬南芥基礎(chǔ)耐熱性和馴化耐熱性所必需的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子。TWA1作為一種植物溫度傳感器,它的發(fā)現(xiàn)和鑒定為通過育種和生物技術(shù)調(diào)整作物的熱馴化反應(yīng)提供了分子工具,并為熱遺傳學(xué)提供了靈敏的溫度開關(guān)。

? Nature Communications: 我國科學(xué)家首次從大豆中克隆出廣譜抗銹病基因,解世界性難題

該文報道了研究團隊首次克隆出大豆中的廣譜ASR抗性基因?qū)pp6907-7/Rpp6907-4,破解了ASR抗性基因匱乏的世界性難題。

? 革新種子篩選技術(shù):精準鑒別活力,提升作物產(chǎn)量

本研究的基于氧氣消耗技術(shù)的種子活力鑒別方法,成功實現(xiàn)了對單粒種子活力的快速、無損鑒別,具有操作簡便、快速準確、無損檢測等優(yōu)點,可廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的種子篩選和質(zhì)量監(jiān)控。未來,隨著相關(guān)技術(shù)的不斷發(fā)展和完善,該方法有望在提高作物產(chǎn)量和品質(zhì)方面發(fā)揮更大作用。

? PBJ:新一代小麥SNP基因分型芯片的開發(fā)和利用

本研究描述了一種新的小麥 SNP 基因分型芯片TaNG 芯片的開發(fā),該芯片旨在克服現(xiàn)有基因分型芯片存在的問題,從而提供比以前版本更全面的基因組覆蓋范圍。

? Ampha Z40/P20花粉活力分析儀在洋蔥花粉檢測中的應(yīng)用

花粉活力分析儀Ampha Z40/P20配合洋蔥專用芯片,可以在不到一分鐘的時間內(nèi)檢測并獲得花粉質(zhì)量和花粉數(shù)量結(jié)果,應(yīng)用于對眾多品系進行以快速、系統(tǒng)地篩選,可顯著提高洋蔥育種和種子生產(chǎn)的效率。

? Nature Communications:de novo起源新基因參與調(diào)控水稻秈粳亞種間粒型的分化

本文系統(tǒng)闡釋了一個de novo 起源新基因GSE9 參與調(diào)控水稻秈/粳亞種間粒型的分化,并為水稻粒型的遺傳改良提供了新的靶基因。

植物生理生態(tài)研究

低溫脅迫下紅花菜豆中STN7激酶激活的非依賴光途徑

2024年6月7日,BMC Plant Biology在線發(fā)表了波蘭華沙大學(xué)Rados?aw Mazur實驗室題為“Light-independent pathway of STN7 kinase activation under low temperature stress in runner bean (Phaseolus coccineus L.)” 的研究論文。文章研究調(diào)查了在黑暗寒冷條件下紅花菜豆(Phaseolus coccineus L.) 中由 STATE TRANSITION 7 (STN7) 激酶驅(qū)動的光系統(tǒng)II捕光天線復(fù)合物(LHCII)的磷酸化過程。研究表明,暗冷誘導(dǎo)了不依賴光的LHCII磷酸化,質(zhì)醌(PQ)庫的過度還原促進了這種磷酸化。這導(dǎo)致了STN7激酶的激活、LHCII的磷酸化和LHCII在類囊體膜的重新定位。

? 探秘光合作用核心:光系統(tǒng)II的光能轉(zhuǎn)換機制

光合作用是地球上所有生命活動的基礎(chǔ),而光系統(tǒng)II正是這一過程的起點。它不僅捕獲陽光,還負責將水分子裂解,釋放氧氣,同時儲存能量。在Photosynthesis Research上發(fā)表的綜述《光系統(tǒng)II中的太陽能轉(zhuǎn)換:原理與結(jié)構(gòu)》中,科學(xué)家們詳細闡述了PSII如何高效地將光能轉(zhuǎn)化為化學(xué)能,并提供了PSII的高分辨率結(jié)構(gòu)圖像。

? 藍藻的“能量緩沖”:糖原合成在光合作用中的關(guān)鍵角色

文章旨在探討糖原在光自養(yǎng)生長向光混合營養(yǎng)生長轉(zhuǎn)換過程中的生理和代謝作用,以及糖原合成對光合作用電子傳遞鏈的影響。

? NC新發(fā)現(xiàn),F(xiàn)PB1蛋白促進光系統(tǒng)II組裝

本研究揭示了一個新的蛋白質(zhì)FPB1(Facilitator of PsbB biogenesis1),它在PSII的組裝中扮演著重要角色,它是PSII積累所必需的。本研究中,光合作用相關(guān)的葉綠素熒光成像和P700氧化還原差示吸收通過MAXI-IMAGING-PAM和DUAL-PAM-100完成。

其他

? PhenoSight物聯(lián)網(wǎng)分布式表型監(jiān)測系統(tǒng)客戶“免費試用申領(lǐng)”活動暨全國經(jīng)銷商招募通告

本上海澤泉科技股份有限公司隆重推出物聯(lián)網(wǎng)分布式表型監(jiān)測系統(tǒng)——PhenoSight?,F(xiàn)誠邀全國區(qū)域經(jīng)銷商,凡具備一定行業(yè)客戶基礎(chǔ),擁有專業(yè)背景知識,敢于挑戰(zhàn)行業(yè)競爭的優(yōu)秀儀器代理商,加入我們共謀事業(yè)發(fā)展,見證品牌發(fā)展。

? 葉綠素熒光儀和光合儀高分應(yīng)用文章集錦(2024年5月)

? 葉綠素熒光儀和光合儀高分應(yīng)用文章集錦(2024年4月)

? 土壤微生物功能對氣候變化適應(yīng)性的研究揭示了覆蓋作物的重要性

隨著全球氣候變化的加劇,極端天氣事件的頻率和強度不斷增加,土壤微生物群落對這些變化的響應(yīng)變得越來越重要。由英國雷丁大學(xué)的Tom Sizmur教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團隊進行了一項關(guān)于土壤微生物功能對重復(fù)干濕循環(huán)的反應(yīng)以及覆蓋作物對這種反應(yīng)的影響的研究。這項研究的結(jié)果為我們提供了關(guān)于如何通過農(nóng)業(yè)實踐來增強土壤對氣候變化的適應(yīng)性的重要見解。

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