AqQua水生生物基金會(huì)項(xiàng)目全球科學(xué)家浮游生物圖像數(shù)據(jù)集征集計(jì)劃
日期:2025-06-27 17:30:34

尊敬的CytoBuoy用戶:  

謹(jǐn)代表AqQua項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人,特此提請您關(guān)注以下內(nèi)容。  

AqQua項(xiàng)目全稱水生生物基金會(huì)項(xiàng)目(The Aquatic Life Foundation Project),是亥姆霍茲基金會(huì)模型計(jì)劃中的一個(gè)試點(diǎn)項(xiàng)目。

每天,全球的研究人員都會(huì)獲取數(shù)百萬張浮游生物圖像。每個(gè)獨(dú)立的數(shù)據(jù)點(diǎn)承載著有關(guān)生物多樣性、水生食物網(wǎng)功能以及相關(guān)水體生態(tài)系統(tǒng)狀況的信息。

圖片1.png 

AqQua 項(xiàng)目將借助歐洲首臺(tái)百億億次超級(jí)計(jì)算機(jī),構(gòu)建首個(gè)遠(yuǎn)洋成像基礎(chǔ)模型,整合來自全球水生環(huán)境的數(shù)十億張圖像。

AqQua 將提供理解生物碳泵所需的關(guān)鍵數(shù)據(jù),生物碳泵是一個(gè)自然過程,能從大氣中封存大量碳,并對全球氣候產(chǎn)生重大影響

他們誠摯邀請您參與AqQua項(xiàng)目——這是一項(xiàng)大規(guī)模協(xié)作計(jì)劃,旨在:  

- 構(gòu)建浮游生物圖像數(shù)據(jù)的AI基礎(chǔ)模型;  

- 將其作為開源工具向全球科研界發(fā)布,以助力各類浮游生物相關(guān)研究;  

- 利用該模型開發(fā)全球浮游生物及顆粒物分布模型,并估算相關(guān)過程速率。  

為實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),AqQua項(xiàng)目目前正收集來自全球不同水生環(huán)境中多種成像設(shè)備的浮游生物圖像數(shù)據(jù)集。為整合出一套兼具多樣性與廣泛性的數(shù)據(jù)集,我們鼓勵(lì)全球科學(xué)家分享各自的浮游生物及顆粒物圖像數(shù)據(jù)。  

令人欣喜的是,我們已收到大量支持響應(yīng),全球已有40多個(gè)學(xué)術(shù)實(shí)驗(yàn)室及非學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)承諾共享數(shù)據(jù)并貢獻(xiàn)專業(yè)力量。  

所有共享數(shù)據(jù)的參與者都將被列為計(jì)劃發(fā)表的數(shù)據(jù)論文的作者。此外,還將受邀積極參與基礎(chǔ)模型論文、全球分布模型及過程速率估算相關(guān)論文的撰寫。因此,即便您的數(shù)據(jù)已處于公共領(lǐng)域,我們?nèi)韵Mc您取得聯(lián)系。AqQua基礎(chǔ)模型的性能很可能與其訓(xùn)練數(shù)據(jù)的類型密切相關(guān),從長遠(yuǎn)來看,共享數(shù)據(jù)或?qū)槟难芯繋碇妗? 

AqQua項(xiàng)目秉持開放科學(xué)理念,所有共享數(shù)據(jù)需允許在2027715日起以CC BY-NC 4.0許可協(xié)議公開發(fā)布(作為計(jì)劃中數(shù)據(jù)論文的一部分)。因此,我們僅接收已公開或最遲可在2027715日前公開的數(shù)據(jù)。  

項(xiàng)目模型訓(xùn)練將于今年秋季啟動(dòng),數(shù)據(jù)提交截止日期為2025731日。如您有意參與,請閱讀并填寫我們的數(shù)據(jù)共享表格。表格將用于說明您所提供的數(shù)據(jù)內(nèi)容、相關(guān)許可或協(xié)議,以及數(shù)據(jù)共享的技術(shù)方式。  

如需了解更多關(guān)于AqQua項(xiàng)目的信息,請?jiān)L問我們的項(xiàng)目頁面。如有任何疑問或建議,歡迎隨時(shí)通過郵箱aqqua@geomar.de與我們聯(lián)系。我們熱切期待您的加入!  

此致  

Rainer KikoAqQua團(tuán)隊(duì)代表)  

項(xiàng)目負(fù)責(zé)人:Rainer Kiko, Dagmar Kainmueller, Klas Ove M?ller, Timo Dickscheid

若您在EcoTaxa平臺(tái)托管圖像數(shù)據(jù),我們是通過該平臺(tái)公開的項(xiàng)目所有者列表獲取您的聯(lián)系方式的?,F(xiàn)特向您詢問是否愿意與我們共享您在EcoTaxa上的特定數(shù)據(jù)集。本項(xiàng)目得到了維拉弗朗什海洋實(shí)驗(yàn)室( Laboratoire d'Océanographie de Villefranche)同事的支持,但他們并非項(xiàng)目成員。  

AqQua項(xiàng)目不會(huì)從EcoTaxa平臺(tái)批量抓取圖像,僅使用明確共享給我們的數(shù)據(jù)。如需從EcoTaxa向我們傳輸數(shù)據(jù),最簡便的方式是為EcoTaxa用戶“AqQua”(郵箱:aqqua@geomar.de)提供查看權(quán)限。我們將通過EcoTaxaAPI下載數(shù)據(jù),下載完成后會(huì)及時(shí)通知您,您可根據(jù)需要修改或撤銷權(quán)限。  

僅項(xiàng)目負(fù)責(zé)人Rainer Kiko(郵箱:rkiko@geomar.de)和數(shù)據(jù)管理員Martin Schr?der(郵箱:mschroeder@geomar.de)有權(quán)訪問aqqua@geomar.de賬戶。  

若您希望通過EcoTaxaAPI批量修改多個(gè)項(xiàng)目的訪問權(quán)限,歡迎使用我們的Python腳本(鏈接:https://codebase.helmholtz.cloud/aqqua-public/ecotaxa-tools)。


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