全自動、高通量對大量小植株進行成像的系統(tǒng)，可以選擇配置可見光（VIS）成像、近紅外（NIR）成像、紅外（IR）成像、熒光成像或激光掃描3D成像（只適合高度15 cm以下的小植株）中的一種或多種。成像系統(tǒng)帶程控移動裝置，可以在X軸和Y軸上進行移動，并配有射頻或條形碼讀取器。Scanalyzer HTS系統(tǒng)通過軟件控制攝像頭移動到樣品上方（多孔板或小盆）進行拍照，照片數(shù)據(jù)與該樣品的電子標記（射頻或條形碼）一起存儲。軟件也可控制攝像頭對多孔板上的每個孔進行單獨成像，每個孔的數(shù)據(jù)分布存儲（告訴軟件多孔板類型，然后自動編碼，如A01、A02……）。