精彩推薦
當(dāng)前位置:AgriPheno > 表型信息學(xué)分析 > 高通量表型
表型產(chǎn)品儀器——溫室型高通量植物表型平臺(tái)
日期:2016-12-19 17:18:00

全自動(dòng)高通量植物3D成像系統(tǒng)——Scanalyzer 3D

全自動(dòng)、高通量對(duì)大量植株進(jìn)行3D成像,從幼苗到成株即可

植物表型和生理研究的強(qiáng)大助手

遺傳育種、突變株篩選、表型篩選的強(qiáng)大工具


主要功能

全自動(dòng)、高通量對(duì)植物等小型樣品進(jìn)行可見光成像、近紅外成像

通過可見光成像可以測(cè)量植物的結(jié)構(gòu)、寬度、密度、對(duì)稱性、葉長(zhǎng)、葉寬、葉面積、葉角度、葉顏色、葉病斑、種子顏色、種子顏色面積等等50多個(gè)參數(shù)

通過近紅外成像可以分析植物的水分分布狀態(tài)、水力學(xué)研究、脅迫生理學(xué)研究


應(yīng)用實(shí)例


植物顏色分類

植物的顏色是反映植物健康狀態(tài)的關(guān)鍵指標(biāo)之一,而人肉眼對(duì)顏色的敏感度較低,存在較大的視覺誤差。利用Scanalyzer系統(tǒng)可以在拍攝植物可見光照片的基礎(chǔ)上,通過軟件對(duì)獲得的顏色信息進(jìn)行銳化處理,從而使原本肉眼不易區(qū)分的顏色差別,顯著的區(qū)分開來。


blob.png



植物骨架/結(jié)構(gòu)分析 

植物骨架和架構(gòu)信息,是非常典型的植物表觀信息,是農(nóng)業(yè)信息學(xué)的重要研究?jī)?nèi)容。對(duì)于雜交育種而言,Scanalyzer系統(tǒng)有助于快速進(jìn)行表型篩選,也可用于了解整個(gè)生活史以及受到脅迫后的骨架/結(jié)構(gòu)變化。

blob.png


植物形態(tài)學(xué)分析

成像后,通過LemnaTec公司專業(yè)的軟件工程師團(tuán)隊(duì)開發(fā)的軟件,可以對(duì)植物進(jìn)行詳細(xì)的三維形態(tài)學(xué)分析。對(duì)于所拍攝的每一張圖片,都可獲得50多個(gè)形態(tài)學(xué)參數(shù)。

blob.png


估算生物量

通過頂部成像和多個(gè)側(cè)面成像,可以獲得植物XY、Z三個(gè)軸的信息,根據(jù)各個(gè)方向的葉面積、莖長(zhǎng)、莖寬、葉長(zhǎng)、顏色等來估算植物的生物量。實(shí)驗(yàn)證明這種估算的生物量與實(shí)際生物量有非常好的線性關(guān)系。


blob.png


利用近紅外(NIR)成像分析植株和土壤的水分利用情況

近紅外成像可以直觀的反映植物不同部位的含水量,通過軟件處理加上代表不同含水量的顏色后,可以非常直觀的看出不同處理下植株不同部位的含水量變化。如果植物是生長(zhǎng)在專用土柱中,還可以對(duì)植物根系和土壤的含水量變化進(jìn)行定量分析。


blob.png


利用近紅外(NIR)成像分析NIR成像分析小麥干燥過程中含水量的變化

本例是小麥在高溫處理下,植株含水量的時(shí)間動(dòng)力學(xué)變化可以通過NIR成像直觀的反映處來,并進(jìn)行定量分析。


blob.png



鑒定非轉(zhuǎn)基因植物

噴灑農(nóng)藥后,沒有轉(zhuǎn)入抗農(nóng)藥基因的植物,可以通過顏色鑒定出來。


blob.png



植物個(gè)體和群體的形態(tài)學(xué)應(yīng)用舉例

Scanalyzer3D成像系統(tǒng)可以獲得大量的形態(tài)學(xué)參數(shù),并且針對(duì)不同的材料,可以獲得有針對(duì)性的參數(shù)。下面是幾個(gè)例子:


blob.png

blob.png



植物開花過程的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè) 

由于絕大多數(shù)植物的花的顏色與莖葉不同,利用Scanalyzer 3D成像系統(tǒng)的高通量、全自動(dòng)、帶電子標(biāo)簽的特性,就可以自動(dòng)監(jiān)測(cè)植物是否開花、開花時(shí)間、花朵數(shù)目、花朵發(fā)育階段、花敗時(shí)間等信息。


blob.png